作為《神雕俠侶》的續集，《倚天屠龍記》的劇情更是跌宕起伏。在郭靖戰死、楊過退隱的亂世時代，中原武林各門各派不僅要面對蒙古人的陰謀詭計，還和明教發生了一系列的恩怨仇殺。
謝遜身為明教的四大護法王之一，他為了報仇假借成昆之名濫殺無辜，早就引起了江湖群雄的不滿。加上謝遜又帶走了屠龍寶刀，這就使得明教和武林各派的關係變得更加岌岌可危、一觸即發。
就在六大門派同仇敵愾圍剿光明頂之際，張無忌挺身而出。他憑藉絕世神功扭轉了戰局，硬生生化解了這一場血腥屠殺。但身為峨眉派掌門人的滅絕師太卻不願欠張無忌人情，不僅自盡而死，還在臨死前逼迫周芷若發下毒誓：「 日後我若對魔教教主張無忌心存愛慕，倘若和他結成夫婦，我親身父母死在地下，屍骨不得安穩；我師父滅絕師太必成厲鬼，令我一生日夜不安，我若和他生下兒女，男子代代為奴，女子世世為娼！」
常言道：冰凍三尺非一日之寒。可見，峨眉派和明教之間積怨已久，他們之間的深仇大恨也並非一朝一夕。既然如此，身為峨眉派的開山鼻祖，郭襄為何不在有生之年將明教一舉殲滅呢？
要知道的是，郭襄從小就愛恨分明、嫉惡如仇，因此當她聽聞江湖裡有位揚善除惡的神雕大俠時，年僅16歲的她就敢跟著西山一窟鬼「夜半私奔」，為的就是親眼目睹神雕大俠的風采。
眼見自己親妹妹跟著他人徹夜未歸，郭芙手持利劍沖進了萬獸山莊和史孟捷大打出手。原文寫道，當史孟捷聽聞郭芙稱呼郭襄為「妹妹」時，他心裡一驚：「難道這女子是神雕大俠的夫人還是姊妹？」硬生生將遞出去的一招縮了回來，急向後躍。
明知對方忍讓，郭芙依舊長劍刺出，只聽「噗」一聲響，史孟捷胸口鮮血狂噴。郭襄大叫：「姊姊，我說這幾位都是朋友。」郭芙怒道：「快跟我回去！誰識得你這些豬朋狗友？」
面對蠻橫無理的郭芙，就算是自己的親姐姐，郭襄也怒不可遏了起來： 「你胡亂出于傷人，我告訴爹爹媽媽去！」史孟捷見她小臉兒漲得通紅，珠淚欲滴，強笑道：」姑娘不用擔心，我的傷死不了人！」
隨著郭襄長大成人，她更是打抱不平。于是當張三豐見到張無忌背後一個綠油油的手印時，就算是身為一代宗師的他也不由得驚愕道：「我只道三十年前百損道人一死，這陰毒無比的玄冥神掌已然失傳，豈知世上居然還有人會這門功夫。」
張三豐為何如此驚愕？可想而知當年的百損道人的武功有多高，有多麼地可怕。奇怪的是，讓張三豐也忌憚不已的百損道人卻在三十年前突然死去。更湊巧的是，郭襄也差不多在30年前香消玉殞。因此有一種說法就是，當年百損道人憑藉玄冥神掌危害江湖，行俠仗義的郭襄找到百損道人之後，二人隨即展開了一場殊死對決。
百損道人不是郭襄的對手，被郭襄當場擊斃，可百損道人也並非泛泛之輩，他臨死前打出的玄冥神掌擊中了郭襄的肩膀。隨著寒毒慢慢入侵，郭襄最後毒氣攻心而死，畢竟那個時候無論是少林、峨眉、武當都沒有全套版的《九陽真經》。
如果是這樣子的話，就能解釋一向心高氣傲的紫衫龍王在提及郭襄的時候，都肅然起敬稱呼她為「郭女俠」了。可見郭襄在倚天初期的的確確是一位名震江湖的女俠，但她為何沒有出手殲滅明教呢？其實，這一切恐怕和明教的第33代教主有關。
明教第33代教主喚作陽頂天，他在中原明教在位20幾年，將明教發展得蒸蒸日上。除此之外，陽頂天將「驅除韃虜」作為自己的畢生夢想，即便波斯總教傳來「降元」的命令，陽頂天依舊斷然拒絕。
將蒙古人趕出中原武林也是郭靖畢生追求的宏願，雖然郭靖帶著黃蓉最後戰死在襄陽城，但後世的陽頂天卻接過了「抗元」的大旗。面對志同道合的戰友，即便明教一向有魔教的說法，郭襄也不忍心對陽頂天痛下殺手。
看過連載版《倚天屠龍記》的朋友會知道，陽頂天原名喚作楊破天，他可是楊過之子。只不過在《神雕俠侶》中，楊過和小龍女之間插進了一個搗亂的尹志平。如今到了《倚天屠龍記》，楊過的兒子楊破天又被成昆趁虛而入，如此俗套的劇情對「楊家」來說，確實太過于「狗血」了。
既然金庸起先將陽頂天設定為楊過之子，而郭襄又和楊過的關係極為親密。面對自己大哥哥的愛子，郭襄怎麼會下得了手？
